Reconstruction probabiliste de généalogies dans une population de rosiers

Les acteurs

Le Laboratoire Angevin de REcheche MAthématiques, l'Institut de Recherche en Horticulture et Semences, le Centre de Recherches Historiques de l'Ouest et le Centre François Viète.

Collaboration scientifique

L'objectif de ce projet pluridisciplinaire est de reconstruire les généalogies potentielles dans une population de rosiers de ploïdies variables (de 2x à 6x) à partir de signaux génétiques et de sélectionner les liens généalogiques les plus probables. 

Une recherche exhaustive permet un choix rétrospectif des parents les plus probables pour un individu en appliquant les probabilités aux lois de la génétique et aux recherches historiques. C'est une véritable enquête mêlant mathématiques, horticulture, génétique, histoire.

Ce travail encore en cours bénéficie d'un financement de l'Université d'Angers et du RFI Objectif Végétal.

Bibliographie
  1. Frédéric Proïa, Fabien Panloup, Chiraz Trabelsi, Jérémy Clotault. Probabilistic reconstruction of genealogies for polyploid plant species. arXiv, 13 April 2018.